分析检查阶段不足之处
尽管在分析检查阶段中，各党（总）支部能严格按照要求工作深入开展活动，取得了一定的实效，但仍发现了不足之处：一是存在对科学发展观的认识还不够深刻的现象；二是个别单位虽然找准了存在的问题，但解决问题的措施不够细化；三是仍存在被动学习的状况，主动意识不够强。
整改落实阶段工作计划
按照“重在创新体制机制、重在人民群众满意”的要求，正确处理好解决突出问题与形成长效机制的关系，集中精力抓整改，着眼长远定制度，使学习实践活动真正成为群众满意工程。这一阶段重点要抓住制定整改方案、公布整改措施、解决突出问题、完善体制机制四个环节。
一、针对问题制定方案
根据分析检查阶段形成的《区卫生局开展深入学习实践科学发展观活动领导班子分析检查报告》，形成《区卫生局关于对阻碍卫生事业科学发展问题的整改方案》，要对查摆出来的突出问题和需要完善的制度，按照轻重缓急和难易程度，明确列出哪些是在学习实践活动中可以立即解决的，哪些是经过努力一段时间可以解决的，哪些是依靠自身力量难以解决的，分别提出整改落实的目标、方式和时限要求，明确分管领导、分管部门，使整改落实工作有章可循，有可操作性。
二、公布方案促进整改
以适当的方式，公布整改方案和任务分解，公布承担整改任务的分管领导和部门，公布整改责任和时限，接受群众监督，促进整改责任的落实。基层党组织和党员要积极建言献策，对整改工作提出合理化建议。
三、突出重点解决问题
对具备条件的问题，要马上整改；对通过努力能够解决的问题，要限期整改；对受客观条件制约一时解决不了的问题，要向群众说清楚；对涉及多个部门和单位的问题，要采取上下互动、左右联动的办法积极解决。
四、区分层次完善制度
各单位要联系实际，根据区委、区政府和局党委的部署制定相关配套文件，针对影响和制约本单位科学发展的关键问题、薄弱环节制定措施。局机关着重建立健全推动科学发展的体制机制，局属单位着重建立健全落实科学发展观的规章制度。