随着中央银行机构改革的深化和核算系统的升级，会计管理工作的加强显得日渐重要，它对促进各项工作上台阶、上水平，全面履行基层央行工作职责具有一定积极作用。但目前基层央行的会计管理工作还存在一些与改革发展不相适应的问题。只有进一步加强会计管理工作，才能更适合金融管理体制改革的发展。
一、会计工作存在的问题
会计工作是基层人民银行各项业务活动的基础,是作好金融管理、履行好中央银行职责的出发点。会计工作在加强内部管理、强化基础建设、完善内控制度、加强财务管理等方面做了大量工作，取得了一定成绩。但随着改革的深入发展，人民银行的会计工作也遇到许多新情况、新问题，在管理体制和管理方法上还存在一些不适应的地方。主要表现在以下几个方面：
一是内控制度滞后，不能有效防范会计风险。随着中央银行会计集中核算系统的推广和应用，制度建设未能及时得到完善和补充，一些业务缺乏制度约束或制度与实际业务操作脱节，制度跟不上业务发展变化的需要，造成控制盲点，不能有效的防范会计风险，有效指导会计工作存在一定欠缺。现行内控制度只是作为对会计人员工作的要求，而没有将其作为法律、法规执行，致使会计业务潜伏着很大的风险隐患。
二是责权不清，缺乏激励机制。会计工作的风险性与待遇不相匹配，从现实情况看，会计未形成一套系统性的内部控制制度、内部操作规程和评价标准，没有真正建立科学有效的激励措施,在一定程度上影响了会计人员的积极性。由于没有切实可行的奖惩措施，致使会计人员提高工作质量、业务能力缺少动力，成为引发内部资金风险的重要根源。
三是缺乏动态预警机制。内控制度对风险的管理应以预防为主，现有的内控制度着重强调了对业务环节的控制及事后监督检查控制，而忽视了对突发性事故或案件的预测预防，没有运用现代信息技术开发出会计内控软件，对业务工作中存在的问题不能及时报警，起不到风险预防作用，跟不上业务发展的需要。
四是人员老化素质偏低。中央银行会计是一项原则性、专业性较强，风险性较高的工作，是央行的要害部门，对人员的政治素质、业务素质要求相对较高。不仅要有扎实的专业知识，还要有较强的工作责任心和良好的职业道德。但随着金融体制改革的不断深化，基层行人员逐渐减少而且结构老化,岗位轮换、交流制度得不到实质性落实。少数人员的知识结构不适应业务发展的需要，工作上只限于被动应付，操作上随意性大。
二、会计工作中存在问题的根源
一是领导重视不够。基层行对会计管理工作存在着不同程度的差异，个别县支行的领导认为会计工作实行双重管理，即上级会计主管部门和单位领导，对会计工作的管理局限于上级主管部门的意见，缺乏对本单位会计管理的主动性和积极性，日常工作仅限于账表平衡，资金不出现问题，有的甚至只关心本行费用指标的多少、经费的松紧，对具体业务不做深入了解。 有的行纯粹把会计部门作为行内业务培训基地，把会计业务熟练的人员充实其他部门，或者经常抽调会计人员搞行里中心工作，使一些会计人员不能正常从事会计业务。
二是岗位设置与现有会计人员配置相互矛盾。按照内控制度的要求，县支行会计国库科承担着国库和会计两项核算业务，还肩负辖内金融系统及国库经收处的管理职责，一般应设置接柜岗、记账岗、复核岗、票据清算岗、清算管理岗、综合岗、系统维护岗、会计主管岗、会计档案管理岗、事后监督等岗位。其中票据交换员、事后监督员、系统维护员、会计主管员不得参与日间账务处理，记账员、复核员不能兼岗，还必须建立定向替岗制度。但实际工作中存在人少岗位多的矛盾。要保证正常业务开展，必须一人多岗，如遇培训、外出检查、正常休假等情况，兼岗和顶班就不可避免。具体矛盾体现在两个方面，一方面不按制度要求充实会计人员，就会不同程度出现混岗、兼岗现象，缺乏岗位制约关系，存在风险隐患；另一方面，县支行人员少，会计业务量也较小，按制度要求充实会计人员，势必造成会计人员占全行人员比重较大，造成人力资源的浪费，不利于县支行其他工作的开展。
三是业务管理有待于进一步协调。基层县支行是具体业务操作部门负责国库、会计、甚至包括科技，业务管理分别接受中心支行会计财务科、营业部、事后监督中心、国库科、科技科五家指导，由于具体工作布置和管理“政出多门”，县支行国库会计科往往感到无所适从。
